Ana içeriğe geç

Seqviz (DNA/RNA haritası)

Bir DNA, RNA veya protein dizisini, üzerindeki bölgeleri (annotasyonları) işaretleyerek dairesel veya doğrusal bir harita olarak gösterir.

Sözdizimi​

```seqviz
{"name":"örnek","seq":"ATGCGTACGTAGCTAGCTAGGCTA","annotations":[{"name":"bölge-1","start":0,"end":10}]}
```

İçerik, seqviz kütüphanesinin kendi görüntüleyici bileşenine geçirdiği JSON: en azından bir seq (dizi) alanı gerekir, name ve annotations (dizinin belirli aralıklarını etiketlemek için) isteğe bağlıdır.

Ne işe yarar​

Bir gen/plazmit haritasını, belirli bir bölgeyi (ör. bir promotor ya da kodlama bölgesi) işaretleyerek göstermek için. Biyoloji notlarında kullanışlı.

Kaynak​

Kütüphanenin kabul ettiği tüm seçenekler (görünüm tipi, renkler, ek annotasyon alanları) için resmi dokümantasyon: github.com/Lattice-Automation/seqviz. JSON'a yazdığın alanlar bu kütüphanenin kendi props şemasına karşılık geliyor, yazarken bu kaynaktan tam alan listesini doğrulamak gerekir.

Tsunagi'ye özgü not​

Kütüphanenin varsayılan davranışı ilk yüklemede bir web fontu indirmeye çalışıyor; Tsunagi bunu kapatıp sistem fontunu kullanıyor, böylece tamamen çevrimdışı çalışıyor.